数十枚～数百枚のシールを作りたいのですがロットは問題ないでしょうか。

はい、印刷可能です。

数十枚から数百枚単位ですと、オンデマンド印刷でのシール作りをお勧めしています。
オンデマンド印刷だと、価格はサイズと枚数に概ね比例します。

ただしオンデマンド印刷は、一般的なアート紙しか使えませんし、形状も四角形になります。

つまりオンデマンド印刷は以下の場合には使うことができません。
・特殊な素材（アート紙以外）で作りたい場合
・変わった形のシールを作りたい場合

上記、オンデマンド印刷で対応できない場合は、別途に版や型を製作してから印刷しますので、版や型の製作費が掛かってしまいます。
版や型の製作費は、印刷枚数が多くても変わりはありません。ロットが大きいほど一枚当たりのシール代は安くなる仕組みです。
価格も数百枚単位だと、版や型の製作費といった初期費用が大きな割合を占めますので、多少印刷枚数を増やしても合計額はさほど変わりません。
ですので、ケーキピックや耐熱タイプなど、特殊なシールであればまとめた数で印刷いただくことをお勧めします。